Jigsaw Sudoku är en variant av Sudoku som använder oregelbundet formade områden istället för vanliga 3x3 block. Reglerna för Jigsaw Sudoku är desamma som vanliga Sudoku, med följande tilläggsregel:
Varje region måste innehålla siffrorna 1 till 9, utan upprepningar.
Detta betyder att pusslet kan ha ett annat antal regioner än ett vanligt Sudoku-pussel, och regionerna kan ha olika storlekar och former.
Sandwich Sudoku innehåller extra nummer utanför rutnätet. Dessa extra ledtrådar anger summan av siffror mellan 1 och 9 i motsvarande rad eller kolumn.